Стр. 29 - А.Я.Николаев - Биологическая химия (2004)

Упрощенная HTML-версия

3 4
Часть I. Строение информационных молекул и матричные биосинтезы
Доменная структура белков
Длинные полипептидные цепи (длиной около 200 аминокислотных остатков или
больше) обычно имеют доменную пространственную структуру. Доменом называ­
ют часть пептидной цепи, образующей как бы самостоятельную глобулу, причем
на одной пептидной цепи может быть два или больше доменов. Домены в одном
белке могут быть одинаковыми или различными как по структуре, так и по функ­
ции. Часто домен по своей структуре и свойствам сходен с отдельным глобуляр­
ным белком. На рис. 1.17,
б
представлена молекула, в которой два крупных, четко
различимых домена.
Супервторичные структуры белков
Нередко в белках, различающихся по структуре и функции, встречаются однотип­
ные сочетания а- и P-структур (структурные мотивы), обозначаемые как супервто-
ричная структура. На рис. 1.18,
а
представлен домен молекулы фермента пируват-
киназы, имеющий супервторичную структуру типа бочонка (она есть и в некоторых
других белках). В этом домене 8 а-спиральных участков образуют «бочонок», внут­
ри которого находятся 8 Р-структурных участков. Многие ферменты содержат до­
мен, в центре которого расположены Р-структурные участки в виде скрученного
листа, и а-спирали, расположенные по периферии домена (рис. 1.18,
6).
Характер­
ные супервторичные структуры имеются в белках, связывающихся с ДНК (см. гл. 4).
Рис. 1.18.
Супервторичная структура:
а — структура типа бочонка в одном из доменов пируваткиназы;
б
— скрученный p-слой и а-спирали,
расположенные по периферии
Изменения конформации белковых молекул
Белковая глобула не является абсолютно жесткой структурой: в известных преде­
лах возможны обратимые перемещения частей пептидной цепи относительно
друг друга с разрывом небольшого числа слабых связей и образованием новых.
Молекула в растворе как бы пульсирует в разных своих частях. Эти изменения
можно рассматривать как тепловое (броуновское) движение отдельных участ­
ков пептидной цепи. Они не нарушают основного плана конформации молекулы,